System ten jest w zasadzie bezobsługowy. Powierzchnia sensora skanera palcowego jest praktycznie samooczyszczająca się dzięki wielokrotnemu użyciu (pociągnięcie palcami). Jeśli skaner palcowy nadal się brudzi, wyczyść go wilgotną (nie mokrą), nie rysującą się szmatką. Odpowiednie są waciki bawełniane, ściereczki z mikrofibry i ściereczki do okularów. Nie nadają się wszystkie tkaniny zawierające bawełnę, ręczniki papierowe i chusteczki papierowe, gąbki kuchenne, nawilżone ręczniki i rolki kuchenne. Stosować czystą wodę bez dodatków detergentowych. Postępować ostrożnie w obszarze sensora.

Jeżeli konieczna jest dezynfekcja całego skanera palcowego łącznie z czujnikiem, można użyć środków wodnych i alkoholowych. Powinny one jednak być w stanie szybko wyschnąć w obszarze działania czujnika. Lakier na skanerze palcowym jest bardzo odporny na wszystkie powszechnie stosowane środki czyszczące i dezynfekujące o czasie ekspozycji krótszym niż 10 minut.